Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.5Q85ZW7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.5Q85ZW7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms