Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg4cQ811C2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg4cQ811C2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg4cQ811C2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms