Protein–RNA interactions for Protein: Q810Y9

Pramel6, PRAMEl6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel6Q810Y9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramel6Q810Y9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramel6Q810Y9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramel6Q810Y9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms