Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NfascQ810U3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms