Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Liat1Q810M6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Liat1Q810M6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Liat1Q810M6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms