Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem39bQ810L4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem39bQ810L4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem39bQ810L4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem39bQ810L4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms