Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm5bQ80Y84 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm5bQ80Y84 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm5bQ80Y84 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm5bQ80Y84 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kdm5bQ80Y84 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kdm5bQ80Y84 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Kdm5bQ80Y84 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Kdm5bQ80Y84 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Kdm5bQ80Y84 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Kdm5bQ80Y84 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Kdm5bQ80Y84 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms