Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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Tspan18Q80WR1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan18Q80WR1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan18Q80WR1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan18Q80WR1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan18Q80WR1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan18Q80WR1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan18Q80WR1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan18Q80WR1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan18Q80WR1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Tspan18Q80WR1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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Tspan18Q80WR1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Tspan18Q80WR1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan18Q80WR1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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