Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbed4Q80WQ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zbed4Q80WQ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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