Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc1Q80VQ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc1Q80VQ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc1Q80VQ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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