Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Actr5Q80US4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actr5Q80US4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actr5Q80US4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms