Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RubcnQ80U62 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RubcnQ80U62 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RubcnQ80U62 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RubcnQ80U62 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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