Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cep170bQ80U49 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cep170bQ80U49 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cep170bQ80U49 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cep170bQ80U49 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.6 ms