Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IfnkQ7TSL0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IfnkQ7TSL0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IfnkQ7TSL0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms