Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcnf1Q7TSH7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnf1Q7TSH7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms