Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Mycbp2Q7TPH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mycbp2Q7TPH6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms