Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf139Q7TMV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf139Q7TMV1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf139Q7TMV1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms