Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Higd1cQ76I25 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Higd1cQ76I25 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms