Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpv1Q704Y3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trpv1Q704Y3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.7 ms