Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SpopQ6ZWS8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SpopQ6ZWS8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SpopQ6ZWS8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SpopQ6ZWS8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms