Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup188Q6ZQH8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup188Q6ZQH8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms