Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Topbp1Q6ZQF0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Topbp1Q6ZQF0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms