Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smg5Q6ZPY2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smg5Q6ZPY2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg5Q6ZPY2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms