Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc154Q6RUT8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms