Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5P0

Tlr11, Toll-like receptor 11, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr11Q6R5P0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr11Q6R5P0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tlr11Q6R5P0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.5 ms