Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2b4Q6Q477 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp2b4Q6Q477 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2b4Q6Q477 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms