Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nudcd1Q6PIP5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nudcd1Q6PIP5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nudcd1Q6PIP5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms