Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sort1Q6PHU5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sort1Q6PHU5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sort1Q6PHU5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms