Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx13Q6PHS6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx13Q6PHS6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx13Q6PHS6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms