Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dhx40Q6PE54 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms