Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms