Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vstm2lQ6PDS0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms