Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dtx4Q6PDK8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dtx4Q6PDK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms