Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mfsd13aQ6PDE8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mfsd13aQ6PDE8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms