Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I6

Cox11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox11Q6P8I6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox11Q6P8I6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox11Q6P8I6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms