Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rrp12Q6P5B0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rrp12Q6P5B0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rrp12Q6P5B0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms