Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Podnl1Q6P3Y9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Podnl1Q6P3Y9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Podnl1Q6P3Y9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Podnl1Q6P3Y9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms