Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hdac10Q6P3E7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac10Q6P3E7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac10Q6P3E7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms