Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RbfaQ6P3B9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RbfaQ6P3B9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RbfaQ6P3B9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms