Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r3aQ6P2K6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms