Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpbp1l1Q6NZP2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms