Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP1

Zranb3, DNA annealing helicase and endonuclease ZRANB3, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb3Q6NZP1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zranb3Q6NZP1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zranb3Q6NZP1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zranb3Q6NZP1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zranb3Q6NZP1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zranb3Q6NZP1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms