Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpdc1Q6NZK8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpdc1Q6NZK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpdc1Q6NZK8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpdc1Q6NZK8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms