Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec23ipQ6NZC7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec23ipQ6NZC7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms