Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Rprd2Q6NXI6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rprd2Q6NXI6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rprd2Q6NXI6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rprd2Q6NXI6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms