Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpsf6Q6NVF9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf6Q6NVF9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms