Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HelbQ6NVF4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HelbQ6NVF4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HelbQ6NVF4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HelbQ6NVF4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms