Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
2810408A11RikQ6NSU2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2810408A11RikQ6NSU2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms