Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc66Q6NS45 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc66Q6NS45 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms