Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mvb12bQ6KAU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mvb12bQ6KAU4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mvb12bQ6KAU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms